Het vergelijken van DNA-sequenties is een befaamd probleem uit de bio-informatica. Hierbij vergelijkt men in het algemeen een onbekende sequentie met een databank vol met gekende sequenties. Vaak vergelijkt men zelfs alle sequenties van een databank met elkaar. De wereld van genetica staat niet stil. De grootte van de databanken stijgt exponentieel. Ook al kent de processorsnelheid ook een expenti??le groei, toch is zij niet gewassen tegen de immense expansie van de databanken. Steeds luider en luider klinkt dan ook de roep naar versnelling. Deze scriptie heeft als doel de gekende algoritmes voor het vergelijken van DNA-sequenties te onderzoeken. E??n ervan wordt vervolgens strategisch geselecteerd. We implementeren deze effectief in hardware op een FPGA met het oog op een zo hoog mogelijke versnelling.